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20 más genomas de patógenos transmitidos por los alimentos revelados por científicos de UC Davis

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20 más genomas de patógenos transmitidos por los alimentos revelados por científicos de UC Davis


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El objetivo es reducir las enfermedades transmitidas por los alimentos. Veinte nuevas secuencias del genoma recientemente han sido encontrados por los científicos de la Universidad de California, Davis, por transmisión alimentaria microbio causante de la enfermedad. Cuanto más se sabe acerca de la prevención de enfermedades transmitidas por los alimentos, mejor se puede alimentar a sus hijos alimentos más seguros.

20 más genomas de patógenos transmitidos por los alimentos revelados por científicos de UC Davis


Anne Hart, Fotografía.

Universidad de California, Davis, Centro de la Food and Drug Administration de los Estados Unidos para la Seguridad Alimentaria y la Nutrición Aplicada, y Agilent Technologies, anunció el 22 de julio 2013, que ha añadido 20 secuencias del genoma recién terminados de origen alimentario microorganismos que causan enfermedades a su base de datos pública en el Centro Nacional de Información sobre Biotecnología, explica un 22, 2013 comunicado de prensa de julio ", 100K Genome Project revela 20 más genomas de patógenos de transmisión alimentaria."

Este esfuerzo de secuenciación del genoma se centra en acelerar el diagnóstico y tratamiento de las enfermedades transmitidas por los alimentos. Los genomas se determinaron utilizando una sola molécula, en tiempo real (SMRT®) la tecnología de secuenciación de Pacific Biosciences de California, Inc. Esto eleva a 30 el número de secuencias genómicas completas por el Proyecto Genoma 100K, que pretende secuenciar los genomas de 100.000 bacteriana y genomas virales.

Ayuda para el diagnóstico y tratamiento de las enfermedades transmitidas por los alimentos

Este esfuerzo de secuenciación del genoma se centra en acelerar el diagnóstico y tratamiento de las enfermedades transmitidas por los alimentos, así como la reducción de la duración y limitar la propagación de brotes de enfermedades transmitidas por los alimentos. Sólo en los Estados Unidos, las enfermedades transmitidas por los alimentos enferman anualmente alrededor de 48 millones de personas y matan a aproximadamente 3.000, según los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades.

Las secuencias recién depositados incluyen varias cepas de Salmonella, Listeria, Campylobacter, Vibrio y, así como una caracterización completa de sus epigenomas - una función de diagnóstico que define cómo se modifica químicamente el ADN y cambia cómo se comporta el organismo.

"Estas secuencias del genoma terminados representan el estándar de alta calidad, con cada cepa cerrado en un solo cromosoma bacteriano y el ADN móvil asociado", dijo Bart Weimer, de acuerdo con el comunicado de prensa. Weimer es el director del Proyecto Genoma 100K y profesor de la escuela de medicina veterinaria de la Universidad de California en Davis. "También contienen fago o plásmido elementos completos asociados, que son fundamentales para entender la patogenicidad, la resistencia a los medicamentos y otros rasgos de importancia biológica que están vinculados a la supervivencia.

"Los genomas que hemos analizado hasta la fecha son los patógenos responsables de infecciones comunes y debilitantes transmitidas por los alimentos", dijo Weimer en el comunicado de prensa, señalando que la disponibilidad de esta información le ayudará a reducir el tiempo necesario para diagnosticar y definir cepas del brote.

"Hacer estas secuencias genómicas disponibles al público a través del Centro Nacional de Información sobre Biotecnología de base de datos proporciona a los investigadores y funcionarios de salud pública con información que permita el seguimiento de los patógenos transmitidos por los alimentos a su fuente", dijo Marc Allard, en el comunicado de prensa. Allard es un experto en genómica FDA y asesor del Proyecto Genoma 100K. "En última instancia, acelerar las investigaciones de brotes, reducir las enfermedades, y facilitar el desarrollo de nuevos métodos de pruebas rápidas para detectar patógenos."

Los nuevos genomas fueron secuenciados y ensambladas utilizando tecnología capaz de detectar e identificar los patrones de metilación de todo el genoma, ya que lleva a cabo la secuenciación del ADN.

"Cada vez más, los microbiólogos están reconociendo que la información epigenética ofrece claves esenciales para la virulencia de una cepa del brote", dijo Jonas Korlach, director científico de Pacific Biosciences. "Las tuberías automatizados que hicieron que la realización de estos 20 genomas y epigenomas posible sirven como una base sólida para la producción de muchos más de alta calidad, acabados genomas de patógenos transmitidos por alimentos a través de este proyecto en el futuro cercano".

Una lista completa de las bacterias para las que terminados los genomas han sido generados por el Proyecto 100K está disponible en línea en el Centro Nacional de Información sobre Biotecnología, un socio en el proyecto. Echa un vistazo a la página web del Centro Nacional de Información sobre Biotecnología.

Sobre el Proyecto Genoma 100K

El Proyecto Genoma 100K fue lanzado en marzo de 2012 como un esfuerzo de colaboración entre la Universidad de California Davis, Agilent Technologies, y la Food and Drug Administration. Desde entonces, los Centros para el Control y Prevención de Enfermedades, Departamento de Agricultura de Estados Unidos y sus socios corporativos adicionales se han unido al esfuerzo de todo el mundo. Primeros datos del proyecto fueron depositados en junio de 2013. Para más información visite la página web del Proyecto 100k.